اینگونه پیش بینی شده بود که بعلت وجود مانع نژادی، سگهای هم نژاد در مقایسه با سگهای غیر هم نژاد از لحاظ ژنتیکی بیشتر شبیه هم خواهند بود. برای آزمایش این پیش بینی، نسبت تنوع ژنتیکی بین سگهای منحصر بفردی که می توان آنها را به عضویت نژادی نسبت داد، تخمین زده شد. آنالیزی از تنوع مولکولی در داده های ریز ماهواره ای نشان داد که تنوع بین نژادها 27٪ از تنوع ژنتیکی کل را تشکیل می دهد. به طور مشابه،میانگین فاصله ژنتیکی بین نژادها که از داده های SNP محاسبه شد FST=0.33 است.
این مشاهدات مطابق با گزارشهای قبلی هستند که نژادهای کمتری را آنالیز کردند و تائید می کردند که موانع نژادی منجر به جدایی ژنتیکی قوی بین نژادها می شود و آشکارا با اختلاف ژنتیکی خیلی پایین تر ( به طور معمول در محدوده 5 الی 10٪) که در جمعیتهای انسانی دیده میشود در تضاد است. تنوع نژادی در سگها در حد اعلای گستره گزارش شده است
.
قسمت دوم
تفاوتهای ژنتیکی قوی بین نژاد سگها این را پیشنهاد میکند که عضویت نژادی را می توان از روی ژنوتیپهای هر یک از سگها مشخص کرد. برای تست این فرضیه نخست یک الگوریتم خوشه بندی بر پایه مدل بیزین (Bayesian) بکار برده شد که درون برنامه ساختار روی داده های ریز ماهواره ای اجرا شد. الگوریتم سعی دارد تا بخشی از جمعیت را که از لحاظ ژنتیکی مجزا می باشد را بر اساس الگوهای تناوب آلل معین کند و در اینجا ساختار روی زیرمجموعه های دارای اشتراک از 20 تا 22 نژاد در یک زمان اجرا شد و مشاهده گردید که اکثر نژادها خوشه های مجزایی را تشکیل میدهند که فقط شامل تمامی سگها از همان نژاد می شوند ( تصویر 1A).
فقط سگهای 4 نژاد بودند که نتوانستند بطور مرتب با دیگر سگها از همان نژاد یک خوشه تشکیل دهند: پرو د پرسا کاناریو (Perro de Presa Canario)، جرمن پوینتر شورت هیر، شپرد استرالیایی و چی وا وا.
* Perro de Presa Canario *
* German shorthaired Pointer *
* Australian Shepherd *
بعلاوه 6 جفت از نژادها در اکثر ردیف ها با هم یک خوشه تشکیل دادند. این جفت شدنهاــ آلاسکن مالاموت و سیبرین هاسکی، شیپ داگ بلژیکی و ترورن بلژیکی، کولی و شتلند شیپ داگ، گری هاند و ویپت، برنیز مانتین داگ و گریت سوئیس مانتین داگ، بول ماستیف و ماستیف – همگی بر اساس تاریخچه نژاد، مورد انتظار بودند. برای تست اینکه این جفتهای نژادی با وجود اینکه به طور نزدیک بهم ربط دارند آیا از لحاظ ژنتیکی مجزا هستند یا نه، ساختار را در مورد هر کدام از این خوشه ها بکار بستیم. در تمامی موارد بغیر از یک مورد خوشه ها مطابق با نژادهای منحصر بفرد به دو گروه تقسیم شدند( تصویر 1B). تنها استثنا خوشه حاوی شیپ داگ بلژیکی و ترورن بلژیکی بود.
* Belgian Tervuren *
The underlying connection was closed: Could not establish trust relationship for the SSL/TLS secure channel.